Evolutionary and Expression Analysis of CAMTA Gene Family in Three Species (Arabidopsis, Maize and Tomato), and Gene Expression in Response to Developmental Stages

نویسندگان

چکیده

The calmodulin-binding transcriptional activator (CAMTA) family has been known to be one of the fast responsive stress proteins. In this study, 17 CAMTA genes were selected in Arabidopsis, tomato and maize. chromosomal distributions, gene structures, duplication patterns, phylogenetic tree, developmental stage CAMTAgenes three species analyzed further investigate their functions. According synteny analysis, maize tomatorevealed higher similarity with each other as compared Arabidopsis. A than 90 percent identity was observed between (ZmCAMTA2 ZmCAMTA3) (SlCAMTA4, SlCAMTA4.1). To detect expression levels different plant tissues, mRNA analysis performed using publicly available data genvestigator. aim study identify characterize species, for first time, via insilico genome-wide approach. AtCAMTA1 AtCAMTA2 SlCAMTA2 ZmCAMTA1 ZmCAMTA2 up-regulated during all stages. conserved motifs structure most proteins group similar, validating classification. This could considered a useful source future comparative studies species.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Microarray analysis of gene expression patterns in Arabidopsis seedlings under trehalose, sucrose and sorbitol treatment

Trehalose is the non-reducing alpha-alpha-1, 1-linked glucose disaccharide. The biosynthesisprecursor of trehalose, trehalose-6-phosphate (T6P), is essential for plant development, growth,carbon utilization and alters photosynthetic capacity but its mode of action is not understood. In thecurrent research, 6 days old seedlings of Arabidopsis thaliana (Columbia ecotype) were grown inliquid cultu...

متن کامل

the stady and analysis of rice agroclimatology in lenjan

the west of esfahan province, iran, is one of the most important agricultural areas throughout the country due to the climate variability and life-giving water of zayanderood river. rice is one of the major and economic crops in this area. the most important climatic elements in agricultural activities which should be considered include temperature, relative humidity, precipitation and wind. so...

15 صفحه اول

a contrastive analysis of concord and head parameter in english and azerbaijani

این پایان نامه به بررسی و مقایسه دو موضوع مطابقه میان فعل و فاعل (از نظر شخص و مشار) و هسته عبارت در دو زبان انگلیسی و آذربایجانی می پردازد. اول رابطه دستوری مطابقه مورد بررسی قرار می گیرد. مطابقه به این معناست که فعل مفرد به همراه فاعل مفرد و فعل جمع به همراه فاعل جمع می آید. در انگلیسی تمام افعال، بجز فعل بودن (to be) از نظر شمار با فاعلشان فقط در سوم شخص مفرد و در زمان حال مطابقت نشان میدهند...

15 صفحه اول

Differential Gene-Expression of Metallothionein 1M and 1G in Response to Zinc in Sertoli TM4 Cells

Background: Zinc (Zn) as an important trace element is essential for testicular development and spermatogenesis. Molecular mechanism of Zn action in the reproductive system may be related to metal binding low-molecular weight proteins, metallothioneins (MT). Our objective was to determine the effect of Zn on two important isoforms of MT, MT1M and MT1G genes expression on testicular sertoli cell...

متن کامل

the study of aaag repeat polymorphism in promoter of errg gene and its association with the risk of breast cancer in isfahan region

چکیده: سرطان پستان دومین عامل مرگ مرتبط با سرطان در خانم ها است. از آنجا که سرطان پستان یک تومور وابسته به هورمون است، می تواند توسط وضعیت هورمون های استروئیدی شامل استروژن و پروژسترون تنظیم شود. استروژن نقش مهمی در توسعه و پیشرفت سرطان پستان ایفا می کند و تاثیر خود را روی بیان ژن های هدف از طریق گیرنده های استروژن اعمال می کند. اما گروه دیگری از گیرنده های هسته ای به نام گیرنده های مرتبط به ا...

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Journal of genetic engineering and biotechnology research

سال: 2022

ISSN: ['2690-912X']

DOI: https://doi.org/10.33140/jgebr.04.01.06